Je souhaite déposer des données brutes de spectrométrie de masse. J’ai un certain nombre de dossiers où un dossier est égal à une acquisition.
Les fichiers contenus dans ce dossier sont une arborescence de fichiers et donc les différentes acquisitions possèdent les mêmes fichiers dans leur arborescence, la seule différence étant le nom du premier dossier.
Par exemple :
ISOLAT_1 : dossier1 dossier2 dossier3; dossier1/pid etc..
ISOLAT_2: dossier1 dossier2 dossier3; dossier1/pid etc..
Je souhaite donc uploader ces dossiers mais ça ne marche pas car les noms sont dupliqués. En compressant chaque fichier, cela ne marche pas non plus car l’outil décompresse systématiquement l’ensemble. J’ai essayé « de tricher » en ajoutant un mot de passe lors de la compression. Ainsi l’outil ne peut pas décompresser le zip et l’archive apparaît comme un fichier unique. Néanmoins ce n’est pas vraiment utile vu la quantité de données que je dois uploader.
Existe-t-il une solution pour faire cela ?
Par exemple cocher une case pour ne pas décompresser l’archive et considérer l’archive comme un fichier…
Le support Data Inra (datainra@inra.fr) a fourni la réponse suivante :
La préservation de l’arborescence des fichiers n’est pas encore supportée sur le portail Data Inra. Cette fonctionnalité devrait être ajoutée à l’occasion de la mise à jour du portail, prévue en octobre 2019.
En attendant cette mise à jour, il est possible de contourner le problème en compressant l’archive dans un format autre que .zip (par ex. .tar).
