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Mendeley Funding pour trouver des financements de recherche

Mendeley Funding est un nouvel outil qui  regroupe les offres de financement au niveau mondial. Il inclut les appel d’offres des organisations les plus importantes  incluant l’Union européenne, les organisations départementales des Etats-Unis comme le National Institute of Health, les UK Research councils etc. Le site recense plus de 22 000 appels d’offre mais seulement 18 appels à projets de l’ANR (voir figure).

Il existe des bases nationales (exemple en Allemagne) ou thématiques de recensement d’appels d’offres. Il existe un service payant Find Funding  de la Foundation Center (50 $ par mois) ou des bases de financements de gros financeurs comme l’Union européene. Mais pour l’instant il ne semble pas qu’il y ait d’autres services équivalents en ligne.

Les chercheurs peuvent rechercher par termes pour les financements pertinents, naviguer par type d’appel d’offres, thématiques ou bailleurs de fonds. Il est possible de sauvegarder les offres intéressantes et d’accéder aux informations détaillées des bailleurs.

Mendeley Funding ; recherche pour les financeurs français

 

 

Accès par http://www.mendeley.com/funding. ll est nécessaire d’avoir un compte.

Source :  Defeo, Christian (2017). Introducing Mendeley Funding. Mendeley Blog. 16 mai 2017.  https://blog.mendeley.com/2017/05/16/introducing-mendeley-funding

Mendeley Data en version test

Mendeley était jusqu’alors une application en ligne pour organiser  annoter  éditer sa partager sa bilbiographie (voir les billets qui abordent Mendeley sur ce blog). L’application est particulièrement utilisée pour récupérer les millions de publications en PDF que les auteurs utilisateurs ont déposé plus ou moins légalement sur la plateforme. Mendeley a été racheté par Elsevier en 2013.

Depuis quelques années le partage des données scientifiques liées aux résultats de la publication devient un enjeu majeur  pour l’intégrité scientifique (pouvoir vérifier le bien fondé des articles) mais aussi pour valoriser la publication,  permettre la réutilisation des données etc. Les revues scientifiques exigent de plus en plus la mise à disposition des données en même que la soumission de l’article.  Plusieurs outils existent pour stocker et diffuser les données : Zenodo, Figshare, Dryad, Pangea… voir la liste des entrepots de données existant  sur http://www.re3data.org/.

Avec Mendeley data,  Elsevier permet aux chercheurs utilisant Mendeley de diffuser  leurs données de recherche. L’application est pour l’instant  en test Bêta. Elle n’apporte rien de très nouveau par rapport aux autres outils cités  (attribution de doi aux données,  licences d’utilisation pour les données et les métadonnées, format de citation du jeu de données). Mais elle permet, pour les utilisateurs de Mendeley, de compléter leur « environnent informationnel »  entre la base de publication des PDF disponibles, le partage de ses propres publications et maintenant les jeux de données.

Les données sont  archivées de manière permanente dans DANS (Data Archiving and Networked Services) situé aux Pays-Bas. Des API (Application Programming Interface) permettront à d’autres applications d’accéder et de s’interfacer avec l’entrepôt de données.

un exemple de dataset dans Mendeley Data

un exemple de dataset dans Mendeley Data

Ce n’est pas vraiment une bonne nouvelle que le principal éditeur scientifique “for profit” se positionne sur ce créneau. La maîtrise par chaque institution du partage  de ses propres  jeux de données est devenu un enjeu primordial pour le fonctionnement d’une science plus ouverte et collaborative.

il vaut mieux déposer ses publications et ses données dans des systèmes institutionnels ou indépendants plutôt que dans des systèmes privés comme Mendeley ou ResearchGate. Voir les prises de position du  CNRS et l’INRIA, et bientôt à l’INRA,  dans ce sens.

source :

Comparaison de programmes de gestion de références — 5ème édition

Source : Comparaison de programmes de gestion de références — 5ème édition. Hortensius. 10 juillet 2015. http://hortensi.us/2015/07/10/comparaison-de-programmes-de-gestion-de-references-5eme-edition/

Le blog Hortensius propose la traduction  (par Thomas Colombéra) du travail effectuée par la bibliothèque de Technische Universität de Munich.

Les outils étudiés – libres, gratuits ou payants – sont : Citavi, Colwiz,  Docear, Endnote, Jabref, Mendeley, Refworks, Zotero.

Accéder au document : http://mediatum.ub.tum.de/doc/1272837/1272837.pdf (19 pages)

Logiciels de bibliographie : comparatifs, tutoriels et formations

Le blog La boîte à outils des historiens a publié un billet  : Se former aux logiciels de bibliographie. Emilien Ruiz. 15 mars 2015.

Il s’agit d’une bonne synthèse des ressources où l’on peut comparer les différents outils de bibliographies et trouver des tutoriels en ligne. Voir le support URFIST  de Frédérique Cohen-Adad sur le panorama des logiciels de bibliographie,  le site form@doct de l’université de Bretagne. Le projet  ECLORE , comparateur de logiciels cité dans le billet, est arrêté depuis 2009.

Les logiciels suivants: Zotero, Mendeley, Jabref,  et Bib-Desk  sont ensuite décrits avec des liens pour accéder aux tutoriels en ligne.

Import des réferences bibliographiques de Mendeley dans WriteLaTeX

Les chercheurs utilisant LaTeX, souhaitent souvent  importer et formater les références bibliographiques avec cet outil. La seule solution était alors de passer par un export des références au format BibTeX et ensuite  de les importer dans LaTeX.

Depuis  Novembre 2014, WriteLateX a travaillé avec Mendeley  sur ses API et propose une intégration avec Mendeley et d’autres outils de gestions bibliographiques (Zotero, CiteuLike). WriteLatex est un éditeur  Latex,  gratuit dans sa version basique, collaboratif et en ligne. Il existe des versions payantes sur une base individuelle et mensuelle qui permettent plus de stockages et de fonctionnalités.  Aucune de ces fonctionnalités n’a été testée.

writelatex

Source : Mendeley integration is here! Import your Mendeley reference library into writeLaTeX. https://www.writelatex.com/blog/184-mendeley-integration-is-here-import-your-mendeley-reference-library-into-writelatex#.VG3Pc8lRoic

Mendeley analyse les contenus des PDF des articles en OA

La version 1.11 de Mendeley Desktop propose une nouvelle fonctionnalité réservée pour l’instant aux PDF des articles publiés en Open Access et présentée comme étant encore en test.

Le logiciel analyse la structure des articles et l’affiche dans un nouvel onglet « Contents ». Ce sommaire  cliquable permet au lecteur de se déplacer très facilement vers une section, une figure ou un tableau spécifique. Dans certains cas, un second onglet « Enrichments » est également activé : il liste les  figures  de l’article et leurs légendes, ainsi que les différents tableaux présents dans le document. Une extraction des données à partir de ces tableaux est possible (Copie au format texte).

Les commentaires des utilisateurs sur ces nouveautés sont encore peu nombreux, et assez neutres pour le moment. On sent poindre cependant une attente  pour des améliorations des fonctions d’annotation et de marquage des pdf  plutôt  que  le développement de nouvelles fonctionnalités en particulier avec la source Science Direct …

Deux nouveautés dans la nouvelle version 1.10.1 de Mendeley Desktop

  • la possibilité de générer les abréviations des titres de périodiques dans les références bibliographiques, en accord avec les instructions aux auteurs. Comme dans d’autres logiciels, EndNote par exemple, les styles intègrent désormais les deux formes des titres : développée et abrégée. A la création des références dans un traitement de texte, la sélection d’un style entraîne automatiquement l’utilisation de la forme demandée par le  journal (donc l’éditeur) correspondant.
    NB : il était déjà possible de générer les titres développés ou abrégés mais la procédure était moins intégrée et supposait de récupérer (éventuellement à partir d’autres logiciels) ou de créer un fichier tabulé avec les deux formes des titres.
  • la possibilité, à partir d’un document enregistré dans sa base, de rechercher des documents connexes. La procédure est très simple : après sélection d’un ou plusieurs documents, ou encore d’un dossier entier, l’activation de la nouvelle commande « Related » déclenche la recherche automatique de documents connexes sélectionnés dans le catalogue Mendeley. Ce catalogue  intègre des documents déposés volontairement par les utilisateurs, des contenus publics disponibles sur Internet et des références issues de sites d’éditeurs. Mendeley propose les résultats de la recherche à l’utilisateur qui peut ou non  intégrer les documents proposés dans sa propre base. Si les droits le permettent, le texte intégral éventuellement associé aux références « recommandées » par cette méthode est également importé.
    Les recommandations proviennent d’une  d’analyse basée sur le contenu du(des)  document(s) sélectionné(s) et ce que les autres utilisateurs ayant des intérêts similaires lisent.
    Cette nouvelle procédure est présentée comme perfectible. Les producteurs du logiciel appellent les utilisateurs à faire des retours sur sa pertinence.

Lu dans la  » Mendeley Librarian Newsletter – September 2013″ et le blog de Mendeley

Nouvelle fonction dans Mendeley

Dans la dernière version de Mendeley, une nouvelle fonction pratique a été ajoutée au Desktop : « Literature Search ».  Elle permet de lancer une requête sur internet et d’intégrer en un clic les résultats intéressants dans sa propre base. Jusqu’à maintenant, ces requêtes ne pouvaient se faire qu’à partir de l’interface web de Mendeley.

On peut faire une recherche sur les champs suivants : auteur, titre, journal, année et limiter les résultats aux seules publications en Open Access. Un module de recherche sur les noms de personnes  (People) et sur les groupes Mendeley (Groups) est annoncé pour bientôt.

Le billet de blog de Mendeley qui annonce le lancement de cette fonction (http://blog.mendeley.com/progress-update/new-release-literature-search-from-within-mendeley-deskop/) donne également quelques détails sur la syntaxe à utiliser pour obtenir les meilleurs résultats.

Nouveau guide en ligne de Mendeley

La « Librarian Newsletter May 2013 » pointe vers un nouveau guide en ligne du logiciel : http://gettingstarted.mendeley.com/#tabs=intro
Dans ce même numéro, on pourra aussi visualiser une vidéo  de Victor Henning « Mendeley and Open Data » présentée lors de la conférence « Rigour and Openness in 21st Century Science » qui s’est tenue en avril dernier à l’université d’Oxford. Cette présentation est très proche de celle qu’il a donnée dans le cadre du tout récent Forum GFII  29-30/05/2013 à Paris.
Après les réactions provoquées par le rachat de Mendeley par Elsevier, V. Henning co-fondateur du logiciel dédramatise, présente sa vision du futur Mendeley et annonce  le développement de différentes applications pour une ouverture plus large vers des plateformes comme Android ou Kindle, vers des outils comme Altmetrics, des outils collaboratifs comme Dropbox ou  EverNote, des plateformes de formation en ligne comme Moodle, des dépôts institutionnels .
Evolutions à suivre …


 

Elsevier achète Mendeley

La rumeur annonçait le rachat de Mendeley par Elsevier. L’information  est confirmée sur le site d’Elsevier (http://elsevierconnect.com/elsevier-welcomes-mendeley/) et sur le blog de Mendeley (http://blog.mendeley.com/press-release/qa-team-mendeley-joins-elsevier/). La  version gratuite est maintenue, avec un doublement de l’espace disponible pour l’utilisateur qui passe de 1 à 2 Gb. De futurs développements sont annoncés. A suivre …