Archives par étiquette : open access

Unpaywall, une extension chrome pour trouver la version des articles en open access

Des outils qui exploitent les infrastructures du libre accès et mettent en valeur  le travail effectué par les revues scientifiques, les archives ouvertes et les bibliothèques sur le libre accès se développent. Ainsi  Unpaywall est une nouvelle extension disponible pour le navigateur Chrome (pas testé avec Firefox)  qui permet de trouver les versions en accès libre (open access) des articles que vous êtes en train de consulter.  Unpaywall, développé par Impactstory, utilise l’api oadoi (voir aussi  le billet sur le blog) qui pointe par défaut sur la version open access des documents.  Unpaywall permet d’accéder aux versions open access des articles légalement déposés en accédant aux sources comme  le DOAJ (répertoire des journaux en libre accès), Crossref (service d’échange de métadonnées des articles des principaux éditeurs), DataCite (gestion des identifants), et BASE ( principal moissonneur des archives ouvertes). (voir le billet de AIMS-FAO).

En consultation, dans le navigateur Chrome, un voyant vert apparaît (s’il n’y a pas de version open access, il est gris):

En cliquant sur le voyant vert, la version open access s’affiche :

 

sources :

MOOCSciNum : Numérique et recherche en santé et sciences du vivant : nouvelles pratiques et enjeux

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Overture des inscriptions pour le MOOCSciNum  » Numérique et recherche en santé et sciences du vivant : nouvelles pratiques et enjeux » qui commencera le 19 octobre.

 

Ce MOOC a pour objectif de donner aux chercheurs, professionnels de la recherche en santé et sciences du vivant et futurs chercheurs français et francophones les éléments nécessaires pour s’adapter à l’évolution des pratiques de recherche en santé (de la gestion à la communication et à la diffusion de ressources scientifiques) et leur permettre de prendre en main les outils numériques associés. Il permettra en outre de saisir certains nouveaux enjeux technologiques, sociaux, juridiques, éthiques tels que le libre accès à la publication scientifique, le partage de données scientifiques ainsi que les changements de méthodologies que le numérique peut introduire dans les pratiques de recherche (data driven research, recherche participative)…. source France Université Numérique.

Inscription sur France Université Numérique https://www.france-universite-numerique-mooc.fr/courses/VirchowVillerme/06005/session01/about. Voir la présentation sur Dailymotion.

Plan du cours (source France Université Numérique)

Séance 0 : Recherche à l’ère du numérique : quelles transformations ? (séance d’introduction)
Numérique et Recherche
Présentation du MOOC

 Séance 1 : S’appuyer sur des ressources scientifiques existantes
Bibliothèque et numérique : quels défis et quels rôles à jouer ?
Savoir gérer sa bibliographie seul ou en groupe avec Zotero

Séance 2 : Collecter/produire des données scientifiques
Numérique et collecte de données en santé
Daydream : un exemple de collecte de données en ligne

Séance 3 : Traiter/analyser des données scientifiques
Données et numérique : quelles « réelles » transformations ?
Recherche en neurogénétique : exemple d’utilisation de Python et de Github
Analyse de données en épidémiologie avec R

 Séance 4 : Archiver/partager des données scientifiques : données de santé, données sensibles
 Des données partagées aux données ouvertes en recherche
Données de santé, données sensibles : quels droits ? Quelles protections ?
Partage de données médicales anonymisées

Séance 5 : Partager ses résultats scientifiques : écrire et publier
Publier sa recherche à l’ère du numérique : Open Access
Droit d’auteur et licences Creative Commons : quelques précisions utiles avant de publier
Déposer un article dans HAL

Paperity, nouvel agrégateur d’articles en OA

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Test très rapide de ce  tout nouvel agrégateur dont l’objectif affiché est de mettre à disposition de façon exhaustive les articles Peer Review publiés en Open Access.

L’interface de recherche est simplissime : une seule fenêtre de recherche à la Google et surtout  ni aide, ni module de recherche avancée visibles ?

Questionné, le site-support,  par la voix de Marcin Wojnarski (fondateur du site) confirme la volonté de démarrer avec un mode search très simple et demande un peu de patience… Il précise que la syntaxe courante utilisée sur la plupart des moteurs de recherche est utilisable sur Paperity et que des spécifications détaillées seront bientôt publiées.

En attendant de plus amples explications, quelques retours sur des essais très rapides :

  • Outre son objectif affiché d’exhaustivité, l’originalité du site tient en l’agrégation (c’est le mot employé)  entre la référence et le texte intégral (pdf). A  la différence de sites proches comme Pubmed Central ou le DOAJ qui exposent les métadonnées des articles mais redirigent vers des sites externes pour l’accès au texte intégral Paperity s’adapterait à toutes les technologies utilisées par les périodiques pour afficher directement les contenus des articles… Effectivement, la lecture des pdf qui se chargent dans une fenêtre sous chaque référence examinée est agréable et assez rapide (mais cela varie selon la source).
  • On a sous la main les commandes habituelles que l’on trouve dans les lecteurs intégrés et en plus, la possibilité de twitter pour partager un document …
  • J’ai également noté quelques  similitudes avec Mendeley : une commande de copie au format txt du contenu des pdf est disponible (cette fonction a été aussi annoncée dans Mendeley – nouvel onglet « enrichments » visible pour certains articles en OA mais rarement (ou plus)  active à ma connaissance) et le système ramène automatiquement à gauche dans une fenêtre « see also » des articles connexes (la fonction « Related Documents » de Mendeley fait la même chose, mais l’algorithme ne me semble pas ramener les mêmes documents).

Pour la syntaxe de recherche, il semble que :

    • les guillemets sont reconnus pour encadrer une expression littérale,
    • le signe + peut être utilisé pour obtenir une combinaison, l’espace pour le OR implicite …
    • les parenthèses permettent d’isoler des groupes de termes …

mais les requêtes sont difficiles à écrire sans règles explicites, ni surtout la possibilité de rechercher ou limiter sur des champs d’interrogation spécifiques. Enfin, à partir de la liste des résultats à une requête d’interrogation, aucune fonction d’export n’est actuellement proposée.

Voilà quelques impressions à chaud sur ce nouvel outil, à suivre…

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ROAD : nouveau répertoire de ressources en libre accès

Lancé en version beta le 16 décembre 2013, ROAD (Directory of Open Access scholarly Resources) est un nouveau service développé par le Centre International des ISSN en collaboration avec l’Unesco. Il répertorie et donne accès gratuitement à un sous-ensemble du registre de l’ISSN formé de notices bibliographiques décrivant des sources scientifiques en libre accès (identifiées par un ISSN) : revues, monographies en série, actes de congrès, dépots institutionnels.
Les notices sont enrichies avec des métadonnées provenant d’autres sources : EconLit, PsycINFO, Scopus, Catalogo (Latindex), Directory of Open Access Journals (DOAJ), The keepers Registry, SCImago, Journals and country Rank (SJR), Source Normalized Impact per Paper (SNIP).
Elles peuvent être téléchargées au format MARC XML et seront disponibles sous forme de triplets RDF en 2014.

Vu sur : Blog UniVersDoc

Les fonctionnalités 2013 de l'archive ouverte HAL

Le CCSD (Centre pour la Communication Scientifique Directe du CNRS) propose un blog pour suivre les derniers développements de l’archive ouverte HAL et de ses portails.

Les nouveautés sont  annoncées dans le billet Et si on parlait de HAL V3 (20 décembre 2012). En voici quelques unes :

  • un nouveau moteur de recherche
  • l’amélioration de la procédure de dépôt
  • la récupération des métadonnées à partir d’un PDF
  • plusieurs « formes auteur » possibles pour un même auteur grâce à un identifiant HAL, mais également un identifiant ORCID
  • la gestion de nouveaux types de documents comme les données expérimentales, qui seront liées à la publication

L’intérêt de ce blog réside aussi dans les commentaires postés par les utilisateurs de HAL. le CCSD peut ainsi « ouvrir » la discussion sur les fonctionnalités à développer ou sur les attentes des utilisateurs.

Source : Et si on parlait de Hal V3 sur Le blog du CCSD : http://blog.ccsd.cnrs.fr/2012/12/si-on-parlait-de-hal-v3/

 

Interopérabilité des entrepôts OAI : état des lieux

La Confederation of Open Access Repositories (COAR) a publié (29/10/2012) un rapport dressant un état des lieux des initiatives actuelles améliorant l’interopérabilité des entrepôts en open access. Ces initiatives brièvement présentées dans la deuxième partie du rapport peuvent concerner des aspects divers liés à l’interopérabilité :
• Le moissonnage des métadonnées : OAI-PMH
• Les réseaux d’entrepôts : DRIVER, OpenAIRE, National repository networks, UK RepositoryNet+
• Les statistiques d’utilisation des entrepôts : COUNTER, KE Usage Statistics Guidelines, OA-Statistik, PIRUS/IRUS-UK, SURE
• L’échange et le transfert de contenu entre entrepôts : SWORD, Open Access Repository Junction, CRIS-OAR Metadata Interoperability
• L’identification des auteurs : AuthorClaim, ORCID
• Les identifiants pérennes : PersID, DOI, Handle System, DataCite
• La gestion des objets complexes : OAI-ORE
• Les recommandations et certifications assurant la qualité et la visibilité d’un entrepôt : DINI Certificate for Document and Publication Services

Un chapitre sur les domaines émergents (p.10) aborde la prise en compte des données de la recherche dans les projets comme OpenAIREplus, RepositoryNet+ ou SWORDv2. Dans un proche avenir, d’autres initiatives de développement concerneront le web de données liées, le Web sémantique et de la préservation numérique.

Vu dans EchosDoc

Lire le rapport : The Current State of Open Access Repository Interoperability (2012)