Archives par étiquette : Zotero

AnyStyle.io : pour créer des références bibliographiques à partir de listes

Un service web au code source libre, qui permet de créer des références bibliographiques pour Zotero et Endnote à partir de listes bibliographiques en mode texte (Word par exemple).

Qui ne s’est pas demandé un jour comment importer ses listes bibliographiques depuis Word vers Zotero ou Endnote sans passer par de multiples copier/coller ?

AnyStyle.io le permet, en passant d’abord par Zotero.

Ouvrir AnyStyle.io dans le navigateur Firefox (sur lequel on a préalablement installé Zotero)

Copier/coller sa liste de références (une dizaine à la fois) depuis Word

Cliquer sur « parse n references » (séquencer) ; sur cet écran on peut modifier les erreurs éventuelles en les surlignant et en cliquant sur « assign label » si on veut les attribuer à un autre champ ou « unknown » si on veut les supprimer …

Sauvegarder (Save) en format BibTex ; les références sont alors récupérées dans Zotero

Vérifier à nouveau qu’il n’y a pas d’erreurs

Si on veut avoir ses références dans Endnote, exporter sa bibliothèque en format xml et dans Endnote l’importer avec l’option « Endnote generated XML »

Sources

AnyStyle.io: convertir ses références bibliographiques en mode texte (Word, etc) dans un format importable dans Zotero. Zotero.hypotheses.org/663. Frédéric Clavert, 22 juin 2014

Anystyle.io : créer des références pour Zotero et Endnote à partir de listes bibliographiques

Zotero 5.0 en version bêta

zoterologoLa version 5. 0 de Zotero est sortie en version beta. Elle amène des changements importants dans la réécriture du logiciel .

Les personnes qui le souhaitent peuvent tester le logiciel en version beta, mais il faut savoir qu’il faut mieux être à l’aise avec l’outil, que cette version ne fonctionne que dans la version Plugin Firefox et que la base de données ne permet pas de revenir vers la version précédente.

Cette version va améliorer la synchronisation entre le  poste de travail et la base en ligne : meilleure performance en particulier pour les bases importantes, sélection unitaire des références à synchroniser  et extension du modèle de données pour la synchronisation.

Deux nouvelles fonctionnalités :

  1. My Publications  qui permettra de créer une liste personnelle de ses travaux : articles, livres, et autres. Si des documents sont attachés, ils pourront être publiquement disponibles sous la licence spécifiée. il est aussi possible de rajouter des listes de publications à un site web.
  2. Feeds support  qui permettra de suivre des flux RSS or Atom à l’intérieur de Zotero dans le panneau de gauche et ensuite d’insérer des références facilement dans Zotero.

source : Dan Stillman.  Zotero 5.0 Beta . 11/06/2016. https://forums.zotero.org/discussion/59829/zotero-5.0-beta/

Zotero : comment organiser sa bibliothèque ?

Le blog Zotero francophone inaugure dans sa rubrique « Trucs et astuces » une série de billets sur l’organisation des documents dans Zotero. Le premier billet traite des collections, marqueurs et recherches enregistrées, leurs avantages et leurs inconvénients.
Suivront des cas concrets d’organisation de bibliothèques personnelles.

Zotero : Comment organiser sa bibliothèque ?

Zotero : ajouter une référence avec le nouveau menu

Le blog Zotero francophone fait un point sur l’utilisation du nouveau menu Zotero apparu avec la dernière version de Firefox. C’est l’occasion de comprendre comment Zotero détecte une référence sur une page Web et la traite en fonction des métadonnées présentes, ou pas, dans la page et dans quel cas un mode alternatif d’enregistrement peut s’avérer préférable au clic sur l’icône qui reste, en général, la meilleure solution,

Ajouter une référence avec le nouveau menu

Comparaison de programmes de gestion de références — 5ème édition

Source : Comparaison de programmes de gestion de références — 5ème édition. Hortensius. 10 juillet 2015. http://hortensi.us/2015/07/10/comparaison-de-programmes-de-gestion-de-references-5eme-edition/

Le blog Hortensius propose la traduction  (par Thomas Colombéra) du travail effectuée par la bibliothèque de Technische Universität de Munich.

Les outils étudiés – libres, gratuits ou payants – sont : Citavi, Colwiz,  Docear, Endnote, Jabref, Mendeley, Refworks, Zotero.

Accéder au document : http://mediatum.ub.tum.de/doc/1272837/1272837.pdf (19 pages)

MOOCSciNum : Numérique et recherche en santé et sciences du vivant : nouvelles pratiques et enjeux

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Overture des inscriptions pour le MOOCSciNum  » Numérique et recherche en santé et sciences du vivant : nouvelles pratiques et enjeux » qui commencera le 19 octobre.

 

Ce MOOC a pour objectif de donner aux chercheurs, professionnels de la recherche en santé et sciences du vivant et futurs chercheurs français et francophones les éléments nécessaires pour s’adapter à l’évolution des pratiques de recherche en santé (de la gestion à la communication et à la diffusion de ressources scientifiques) et leur permettre de prendre en main les outils numériques associés. Il permettra en outre de saisir certains nouveaux enjeux technologiques, sociaux, juridiques, éthiques tels que le libre accès à la publication scientifique, le partage de données scientifiques ainsi que les changements de méthodologies que le numérique peut introduire dans les pratiques de recherche (data driven research, recherche participative)…. source France Université Numérique.

Inscription sur France Université Numérique https://www.france-universite-numerique-mooc.fr/courses/VirchowVillerme/06005/session01/about. Voir la présentation sur Dailymotion.

Plan du cours (source France Université Numérique)

Séance 0 : Recherche à l’ère du numérique : quelles transformations ? (séance d’introduction)
Numérique et Recherche
Présentation du MOOC

 Séance 1 : S’appuyer sur des ressources scientifiques existantes
Bibliothèque et numérique : quels défis et quels rôles à jouer ?
Savoir gérer sa bibliographie seul ou en groupe avec Zotero

Séance 2 : Collecter/produire des données scientifiques
Numérique et collecte de données en santé
Daydream : un exemple de collecte de données en ligne

Séance 3 : Traiter/analyser des données scientifiques
Données et numérique : quelles « réelles » transformations ?
Recherche en neurogénétique : exemple d’utilisation de Python et de Github
Analyse de données en épidémiologie avec R

 Séance 4 : Archiver/partager des données scientifiques : données de santé, données sensibles
 Des données partagées aux données ouvertes en recherche
Données de santé, données sensibles : quels droits ? Quelles protections ?
Partage de données médicales anonymisées

Séance 5 : Partager ses résultats scientifiques : écrire et publier
Publier sa recherche à l’ère du numérique : Open Access
Droit d’auteur et licences Creative Commons : quelques précisions utiles avant de publier
Déposer un article dans HAL

Rédiger sa bibliographie de thèse avec Zotero et Latex

Ce petit guide donne de précieuses indications pour les chercheurs (es) qui utilisent Zotero et souhaitent intégrer leurs références bibliographiques dans LateX. Il sera également très utile pour les formateurs interne de l’Inra (Programme Mister et autres) qui sont souvent confrontés à ces questions lors de leurs interventions.

Source : LateX avancé. Faire sa bibliographie de thèse avec Zotero et LaTeX.  .  16 février 2015.  http://fr.slideshare.net/SCDAMU/faire-sa-bibliographie-avec-zotero-et-latex

Logiciels de bibliographie : comparatifs, tutoriels et formations

Le blog La boîte à outils des historiens a publié un billet  : Se former aux logiciels de bibliographie. Emilien Ruiz. 15 mars 2015.

Il s’agit d’une bonne synthèse des ressources où l’on peut comparer les différents outils de bibliographies et trouver des tutoriels en ligne. Voir le support URFIST  de Frédérique Cohen-Adad sur le panorama des logiciels de bibliographie,  le site form@doct de l’université de Bretagne. Le projet  ECLORE , comparateur de logiciels cité dans le billet, est arrêté depuis 2009.

Les logiciels suivants: Zotero, Mendeley, Jabref,  et Bib-Desk  sont ensuite décrits avec des liens pour accéder aux tutoriels en ligne.

Import des réferences bibliographiques de Mendeley dans WriteLaTeX

Les chercheurs utilisant LaTeX, souhaitent souvent  importer et formater les références bibliographiques avec cet outil. La seule solution était alors de passer par un export des références au format BibTeX et ensuite  de les importer dans LaTeX.

Depuis  Novembre 2014, WriteLateX a travaillé avec Mendeley  sur ses API et propose une intégration avec Mendeley et d’autres outils de gestions bibliographiques (Zotero, CiteuLike). WriteLatex est un éditeur  Latex,  gratuit dans sa version basique, collaboratif et en ligne. Il existe des versions payantes sur une base individuelle et mensuelle qui permettent plus de stockages et de fonctionnalités.  Aucune de ces fonctionnalités n’a été testée.

writelatex

Source : Mendeley integration is here! Import your Mendeley reference library into writeLaTeX. https://www.writelatex.com/blog/184-mendeley-integration-is-here-import-your-mendeley-reference-library-into-writelatex#.VG3Pc8lRoic

L’intégration de Zotero avec les dépots institutionnels financée par Andrew Mellon Foundation

L’équipe de Zotero a annoncé hier l’octroi d’une bourse de l’Andrew Mellon Foundation à hauteur de 440 000 dollars pour financer une collaboration entre les universités George Mason et Penn State. Le but de cette collaboration est  l’intégration de Zotero avec les dépôts institutionnels :  récupération des information par glisser/déposer, mais aussi des dépôts de chercheurs de  l’Université Penn State (dans leur site de dépôt ScholarSphere à partir de Zotero.

Pour en savoir plus,  lire la source de ce billet : Clavert, Frédéric. “Quelques Nouvelles Sur Le Futur de Zotero.” Zotero Francophone, April 17, 2014. http://zotero.hypotheses.org/628.

voir aussi : Takats, Sean. “Feeds and Institutional Repositories Coming to Zotero.” Zotero, April 16, 2014. http://www.zotero.org/blog/feeds-and-institutional-repositories-coming-to-zotero/.